C-反应蛋白不受红细胞、血色素、脂质及年龄等因素的影响，是反应炎症、感染和疗效的良好指标。作为一种急性时相蛋白，C-反应蛋白在许多情况下比血沉更能精确、可靠和及时地反映多种风湿病如风湿热、类风湿关节炎、成人斯蒂尔病、强直性脊柱炎、赖特综合征和各种血管炎等病情的活动及系统性红斑狼疮有无并发感染等。在反映病情活动时，C-反应蛋白明显升高提示病情活动，临床常以C-反应蛋白维持在10mg/L以下为治疗目标。C-反应蛋白增高还可见于肺炎、肾炎、恶性肿瘤及急性感染、外伤和组织坏死、心肌梗死、心功能不全、多发性骨髓瘤、白血病、胆石症、肝炎、痢疾、风湿热、多肌炎、系统性硬化症、结节性多动脉炎、结核和疫苗接种等。但病毒感染时通常为阴性或弱阳性，故可作为细菌感染与病毒感染的鉴别指标，当怀疑有感染时，应进一步进行血培养、体液涂片革兰氏染色、抗结核抗体、PPD试验、胸片等检查。